| 序号 | 科研平台名称 | 类别 |
| 1 | 东北农业大学智慧水网研究中心 | 校级科研机构 |
| 2 | 东北农业大学松花江流域生态环境保护研究中心 | 校级科研机构 |
| 3 | 东北农业大学生态农业与水土环境修复研究中心 | 校级科研机构 |
| 4 | 东北农业大学生物菌剂研发中心 | 校级科研机构 |
| 5 | 东北农业大学生物学（植物类）基础研究中心 | 校级科研机构 |
| 6 | 东北农业大学红色资源发展与教育研究中心 | 校级科研机构 |
| 7 | 东北农业大学大学生思想政治工作创新发展中心 | 校级科研机构 |
| 8 | 东北农业大学中新园艺作物胁迫抗性国际联合研究中心 | 校级科研机构 |
| 9 | 东北农业大学农业功能分子设计与利用实验室 | 校级科研机构 |
| 10 | 东北农业大学行为科学与数字“三农”实验室 | 校级科研机构 |
| 11 | 东北农业大学-新加坡国立大学（NEAU-NUS）食源性蛋白质科学国际联合实验室 |
校级科研机构 |
| 12 | 东北农业大学中俄特色粮油食品科技创新国际联合实验室 | 校级科研机构 |
| 13 | 东北农业大学谷物精深加工高值化利用产业技术研究院 | 校级科研机构 |
| 14 | 东北农业大学生物经济研究院 | 校级科研机构 |
| 15 | 东北农业大学中兽医研究所 | 校级科研机构 |
| 16 | 东北农业大学伦理文化研究所 | 校级科研机构 |
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